Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms