Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Usp38Q8BW70 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp38Q8BW70 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp38Q8BW70 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms