Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms