Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a9Q8BGD6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms