Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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