Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms