Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChfrQ810L3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms