Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Amigo1Q80ZD8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Amigo1Q80ZD8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Amigo1Q80ZD8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Amigo1Q80ZD8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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