Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms