Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sestd1Q80UK0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms