Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TwistnbQ78WZ7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms