Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Topbp1Q6ZQF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms