Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

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Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp34Q6ZQ93 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp34Q6ZQ93 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp34Q6ZQ93 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp34Q6ZQ93 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp34Q6ZQ93 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp34Q6ZQ93 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp34Q6ZQ93 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp34Q6ZQ93 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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