Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms