Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms