Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krba1Q6NXZ1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms