Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CltbQ6IRU5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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