Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp7Q6A4J8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms