Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Irf4Q64287 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Irf4Q64287 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Irf4Q64287 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms