Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms