Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lcn4Q62472 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lcn4Q62472 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Lcn4Q62472 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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