Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20865Q62460 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20865Q62460 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms