Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ndufa4Q62425 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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