Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six1Q62231 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms