Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms