Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctr9Q62018 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms