Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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