Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf3Q60980 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf3Q60980 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms