Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atf3Q60765 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms