Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SkiQ60698 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms