Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sin3aQ60520 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sin3aQ60520 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms