Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms