Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms