Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psme4Q5SSW2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psme4Q5SSW2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms