Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp18Q5SSI6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Utp18Q5SSI6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms