Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtp3Q5QGU6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms