Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms