Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ecm2Q5FW85 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms