Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms