Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc110Q3V125 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms