Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
B230104I21RikQ3USW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B230104I21RikQ3USW4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms