Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms