Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrc4Q3UP24 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms