Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdgfl2Q3UMU9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms