Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrch2Q3UMG5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms