Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms