Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx3lQ3UIR3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dtx3lQ3UIR3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms