Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Srsf6Q3TWW8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms