Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TchpQ3TVW5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms