Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms